Villedieu Intercom a maintenu cinq commissions thématiques afin de préparer les décisions du conseil : développement, ressources, services, patrimoine et stratégie financière. Leur composition a ensuite été installée sous les appellations Développement et Aménagement, Ressources, services publics et santé, Éducation et cadre de vie, Patrimoine et transitions, et Stratégie et représentation de l’EPCI.
Les élus ont également désigné leurs représentants dans de nombreux organismes : PETR, programme LEADER, office de tourisme, Manche Numérique, Initiative Locale, mission locale de Granville, SDIS, hôpitaux du Sud-Manche, collèges, cinéma, école de musique, syndicats de déchets et de rivières, sites Natura 2000, SAGE et SDEM50. Ces mandats couvrent les services et projets qui touchent directement le territoire.
La commission Stratégie et représentation de l’EPCI, réunissant notamment le président et les vice-présidents, aura pour rôle de préparer les grandes orientations de l’intercommunalité. Pour comprendre le fonctionnement de cette instance, il est utile de savoir qui siège au conseil intercommunal et comment sont gérées les compétences locales. Les commissions associent aussi des conseillers municipaux non communautaires pour élargir le travail préparatoire.
Cette organisation fait suite à l'élection de l'exécutif, marquée par le fait que Charly Varin a été reconduit à la présidence. L'installation de ces commissions permet désormais à la collectivité de structurer son action, conformément aux dispositions du portail de l'État pour les collectivités territoriales sur les dossiers financiers et la gestion des services publics de proximité.